Si lo que queremos hacer es guardar una copia de nuestra base de datos MySQL o tablas individuales (hacer un backup), lo podemos hacer con PHP através del siguiente script:

<?php
//Ponemos los datos de acceso a nuestra base de datos
//y ejecutamos la función
backup_tables('localhost','root','root','bd');

/* Hacer backup de una base de datos o de una tabla */
function backup_tables($host,$user,$pass,$name,$tables = '*')
{
  
  $link = mysql_connect($host,$user,$pass);
  mysql_select_db($name,$link);
  
  //obtenemos todas las tablas
  if($tables == '*')
  {
    $tables = array();
    $result = mysql_query('SHOW TABLES');
    while($row = mysql_fetch_row($result))
    {
      $tables[] = $row[0];
    }
  }
  else
  {
    $tables = is_array($tables) ? $tables : explode(',',$tables);
  }
  
  foreach($tables as $table)
  {
    $result = mysql_query('SELECT * FROM '.$table);
    $num_fields = mysql_num_fields($result);
    
    $return.= 'DROP TABLE '.$table.';';
    $row2 = mysql_fetch_row(mysql_query('SHOW CREATE TABLE '.$table));
    $return.= "\n\n".$row2[1].";\n\n";
    
    for ($i = 0; $i < $num_fields; $i++) 
    {
      while($row = mysql_fetch_row($result))
      {
        $return.= 'INSERT INTO '.$table.' VALUES(';
        for($j=0; $j<$num_fields; $j++) 
        {
          $row[$j] = addslashes($row[$j]);
          $row[$j] = ereg_replace("\n","\\n",$row[$j]);
          if (isset($row[$j])) { $return.= '"'.$row[$j].'"' ; } else { $return.= '""'; }
          if ($j<($num_fields-1)) { $return.= ','; }
        }
        $return.= ");\n";
      }
    }
    $return.="\n\n\n";
  }
  
  //guardamos el archivo
  $handle = fopen('db-backup-'.date("d-m-Y").'.sql','w+');
  fwrite($handle,$return);
  fclose($handle);
}
?>

El archivo lo guardará en formato .sql con el nombre db-backup seguido de la fecha en que se creó el archivo, por ejemplo, «db-backup-14-11-2012.sql«.

Además si queremos por ejemplo que este script se ejecute todos los días, podemos usar CRON JOBS de Cpanel tal y como expliqué en el artículo anterior.